中国古代先民仰观天文，俯察地理，经过漫长时期的观测，发现太阳系各大行星的运转规律与地球上的自然和人事现象的运动变化规律之间存在着某种内在规律性联系，特别是木星和土星的运行规律对地球影响很大。现代科学告诉我们，在太阳系中，各个星球的大小是不同的，它们与地球的远近也是不同的。在风水上，体积越，大风水的影响越大；距离越近，风水的影响越大。这也是古人为什么如此重视“日”和“月”的原因。因为，太阳虽远，但体积巨大，月亮虽小，但距离很近。但是，在太阳系中，不仅有日月，其它星球同样会对地球产生影响。太阳系中，木星的体积和重量仅次于太阳，是地球的318倍，木星绕太阳一周为12年。古人发现木星对地球影响也很大，十二生肖便来源于此，所以木星又叫“岁星”。两外，土星也是比较大的一颗行星，它围绕太阳一周约30年。其最小公倍数便是60，这或许是天干地支60年为一个循环（六十花甲子）的来历。据说，太阳系九大行星相会周期是180年。这恰好与玄空风水三元九运的时间周期一元为60年、三元为180年划分相一致。
土星与木星每隔二十年就要相会一次，处在一条直线上。当土、木二星相会时，地球上往往会发生一些重大的地质灾难和自然灾难，人们的行为也会出现某种明显的异常反应。观察、研究还发现，土星、木星与水星每隔六十年就要在一条直线上相会一次，并且，每隔一百八十年，太阳系的九大行星就会同处于太阳的一侧，分布在一个小的扇面内，形成九大行星的大会合，古代天文学家称其为“九星连珠”。这种天体运行规律循环往复，永不改变。古人洞悉这一天机，把黄帝元年(公元前2697年)定为始元，这一年是甲子年，此后，每过六十年为一个甲子周期，称为一元或一大运。每一大运六十年分三个小运，每个小运二十年。以一百八十年作为一个正元，即上元是一运、二运、三运，中元是四运、五运、六运，下元是七运、八运、九运，从而构成了完整的三元和九运体系。黄帝命大桡氏以干支纪年，定此年为黄帝元年，以甲子为始元，以冬至日子时为甲子年甲子月甲子日甲子时。
此外，北斗七星（实际为九星，包括左辅星和右弼星）的运行规律与地球上自然现象和人事吉凶之间存在某种相应的暗合关系。在三元九运的不同时间，都有其中一颗星起着主导作用，并且，每颗星对地球发挥作用的时间正好为二十年。古代先贤们将北斗九星分别取名为贪狼、巨门、禄存、文曲、廉贞、武曲、破军、左辅、右弼星，并确定了三元九运中每一运的二十年由哪颗星主事，即以二十年作为一运，由北斗九星轮流掌管。
我国风水术在唐代以前是没有理气内容的，因为那时还没有理气必备的工具——罗盘。宋代之后，随着罗盘的问世，风水术才逐渐增加了愈来愈多的理气内容，罗盘上的理气层次也由开始的一层两层变成了三十六层乃至四十八层不等。最早比较有系统的理气方法，是以北宋中期风水名家厉伯韶创立的“三合派”理气法。该派以七十二龙为中心，以父母三般卦（即坎离震兑四大局）为重点，要求龙合向，向合水，水合三吉位。而且龙和水必须来自生旺之方，水流须归墓库休囚之地。此后，一般地师便纷纷以三合派为宗，“专以三合水口随地可以定向，于是谈地学者舍形法而言理气（《四库总目提要》语）”。
本来，杨公风水只讲峦头，不讲理气。点穴立向也只是寻其自然之穴，顺其自然之向，一切砂水朝案均就其自然之势，不假丝毫的人为装点（参阅笔者博文“论穴本天成”）。但自三合派兴起后，愈来愈多的地师为了达到龙向水三合的目的，便不顾龙穴的天然朝向，人为地用罗盘来装点龙穴砂水与朝向。这样做，让地师拥有了很大的主动权，龙穴砂水向都成了他们眼中可以随意取舍的东西，一丘一壑，一湾一泡，随处都可以装点，正如《四库总目提要》所说的“随地可以定向”了。固然，这种做派迎合了地师们“想要发谁就发谁，想要何时发就何时发”的权力欲望，使他们趋之若鹜，爱之若宝。但是结果呢，却破坏了龙穴的天然朝向，孟浪宝地，犯了杨公所说的“穴吉葬凶，形同弃尸”的大错。
于是，一种全新的理气派别——三元玄空派，便应运而生。元末明初的风水名师幕讲僧著《玉镜正经》一书，将邵雍的三元九运之说配之以九气流行之法，以洛书九畴顺逆挨飞，而将二十四位分配紫白，以定山水的旺衰。首创三元地运诀、三元旺气诀与三元龙运诀。故《四库全书总目提要》云：“大抵因皇极经世而推演之，其法出自明初宁波幕讲僧。”
及至清初蒋大鸿氏出，在《玉镜正经》的基础上，他又将《易经》的卦爻也纳入风水理气，并以顺逆四十八局替换了三合派的金木水火四大局，以六十四卦三百八十四爻替换了三合派的七十二龙二百四十分金，废除了天盘和人盘，单用地盘格龙立向消砂纳水（世称蒋盘），舍去了三合派仅以方位论吉凶的旧法,而以龙穴砂水之得运失运来论吉凶。故蒋氏在其《地理辨正》序言里说：“深信地理不外易理方圆两图，邵子皇极经世由此而推也。”由于该派理气引进了国人敬若神明的《易经》卦爻，以及邵雍的元运之说，显得比三合派理论更加合理，更加完善，也更加玄妙。因此，它很快赢得了广大地师们的青睐，大家又纷纷舍三合而从三元，使三合派迅速走向衰微，濒临湮灭。
蒋氏在其《平砂玉尺辨伪》一书中狠批了三合派和天星派等以方位论吉凶的做法，说：“周天二十八宿分布十二宫，皆能为福，皆能为灾。地之二十四干支，上应列宿，亦犹是也。何以在此为吉，在彼为凶，此与天星之理全乎不合”；“又以龙脉之左旋又旋，而分五行之阴阳，曰亥龙自甲卯乙丑艮寅壬子癸方来者为阳木龙，亥龙自未坤申庚酉辛戌乾方来者为阴木龙，其余无不皆然，谬之又谬者也。又以龙之所属而起长生、沐浴、冠带、临官……举世若狂，以为定理，真可哀痛！”“更有谓龙之生旺墓若不合，别有立向消纳之法，或以坐山起五行，或以向上论五行，不知山龙平壤皆有一定之穴，生成之向，岂容拘牵某字以意推移朝向论五行，固为乖谬……至于方位五行，不特小元空生克出入，宗庙、洪范、双山、三合，断不可信！”意即：无论是山龙还是平阳龙，龙穴都是自然生成的，有生成之穴，就有生成之朝向，既然穴向都是天造地设不可推移的，也就用不着地师拿罗盘消砂拨水，使砂水符合罗盘上的吉字吉位。所以，什么三合、双山、天星之类的立向消纳之法，均不可信。
此外，蒋氏还多次引用无名氏《天玉经》的话说：“颠颠倒，二十四山有珠宝；逆顺行，二十四山有火坑。”意谓罗盘上的二十四个方位，位位都是珠宝位，位位也都是火坑位，区别珠宝与火坑的唯一法子，便是按三元九运而论。得运之位即是珠宝位，失运之位即是火坑位。蒋氏还对其弟子姜垚说：“杨圣倒杖之法，并无第二法门，不过知元运旺于何宫，在何宫葬之，则自然之阴阳已得，何必再用罗盘（语见姜垚《从师随笔》）。”意思很清楚，使用罗盘的目的不过是为了知道元运旺于何宫何位，如果知道了元运旺于何宫何位，也就能使砂水合于自然的阴阳，那也就用不着使用罗盘了。这就是说，点穴立向只要顺其天然生成之向，便能暗合自然阴阳之理，讲理气不是为了“正神正位装，拨水入零堂”，使砂水为我所用，而仅仅只是为了推断“何时才能发富发贵”的应期，并不是用来定位立向、消砂拨水的。
简单点说，就是三元玄空派摒弃了各种方位理气说，只以元运论山水的旺衰，并以之推断吉凶应期。无论何宫何位，得运则论吉，失运则论凶。
以此为基础，通过三元九运与洛书九宫、北斗九星、以及九气间的有机结合，建立和发展了一套“时”与“空”统一的、可以推算阳宅运气和人的吉凶祸福的较为完备的玄空风水理论。
三元九运每一元为60年，即干支纪年的一个循环，又叫一甲子。而年份的划分按照干支历是以立春节气为岁首的，并非公历的1月1日或夏历（农历）的正月初一。列对应关系如下：
上元一运甲子癸未二十年，配合一白，叫一白运。
上元二运甲申癸卯二十年，配合二黑，叫二黑运。
时空划分法
时空划分法
上元三运甲辰癸亥二十年，配合三碧，叫三碧运。
中元四运甲子癸未二十年，配合四绿，叫四绿运。
中元五运甲申癸卯二十年，配合五黄，叫五黄运。
中元六运甲辰癸亥二十年，配合六白，叫六白运。
下元七运甲子癸未二十年，配合七赤，叫七赤运。
下元八运甲申癸卯二十年，配合八白，叫八白运。
下元九运甲辰癸亥二十年，配合九紫，叫九紫运。
划分方法
“上下四方为宇，往古来今为宙，宇和宙分别是指空间和时间”。人生只是宇宙中的一部分，而且是极其渺小的一部分，时间的碾轮推送着我们不断向前，我们所居住的星球就是这样的一个时间大轮子。木星环绕太阳一周约十二年，土星环绕太阳一周约三十年。木星与土星大约二十年会合一次，两大星球的会合，会以我们意识不到的方式对我们施加种种影响。所以玄学家们以二十年来划分一个元运。玄空飞星一派就是认为二零零四年是下元的八运的新开始，我们正进入一个新的时代之中，这个时代中房地产、农牧业等相关土行的行业会更繁荣，宗教玄学昌盛，社会的管理者会越来越年轻化，年青的男子比较容易获得成功……。这一切都是时空的变化所造成的。
人生如此般的渺小，而我们的先贤们居然能够窥知无限宇宙之真理，并创造了伟大的“三元九运”的时空划分方法，这是人所创造的“神迹。”六十干支就是十天干配十二地支，组成了六十对天干配地支的组合，我们称之为“六十甲子。”一个甲子六十年，六十刚巧又是木星公转十二年和土星公转三十年的最小倍数。六十年也是土、木、水三颗行星的会合周期。三个甲子合计为一百八十年，一百八十年太阳系九大行星同处于太阳的一侧，分布成一个扇面形状，形成了九星大会合。二十年一小运，六十年是一个元，三个元合计九个小运。
这就是“三元九运”，分别是：
三元 —— 上元、中元、下元
上元 —— 一运、二运、三运
中元 —— 四运、五运、六运
下元 —— 七运、八运、九运
三元九运中的元和运都是六十甲子代表不同的能量气场的符号，一、二、三、四、五、六、七、八、九说的是一坎水、二坤土、三震木、四巽木、五黄土、六乾金、七兑金、八艮土、九离火。在“洛书九宫”中，五黄土占据中央，八卦依照某种次序分布周围，它们不只是卦，它是宇宙中的不同的信息场。有观点认为，“洛书九宫”是史前文明，而据此发明的“三元九运”则反映了一种消长原理，宇宙间的这种能量信息会随着时间的运行而发生周期性的变化，周而复始。
“三元九运”以每五百四十年为一个大元，每一百八十年为一个正元，每一个正元又可分为三个单元，分别是上、中、下三元，每一元又可分三个运。在不同的元运时间的变化之中，相同的空间会有不一样的气场变化；在相同的元运时间中，不同的空间会有不一样的气场变化。
玄空派风水中，元运的飞星便是旺星财星，2004年—2023年下元八运中，艮卦，八白左辅星所到之处，便是当时得令财；2024年—2043年下元九运中，离卦，九紫右弼星所到之处，便是当时得令财；2044年—2063年上元一运中，坎卦，一白贪狼星所到之处，便是当时得令财。因此从宅运上来看，“到山到向”的下元八运的坐未向丑和坐丑向未的房宅便是立的最旺的卦线。在流年风水中，八白所到的宫位便是这一年里的旺财位。如果你入住了八运的到山到向的楼，又流年布置合法，风水认为必主兴旺大发。
自然与风水并不是固定不动，而是流动不息的，就好象风永远都吹着，水永远都流着，永无开始，永无结束。所以说风水的影响是流变的，飘忽而又顺从的。不同方位在相同的时间有着不同的吉凶，不同时间在相同的方位也有着不同的吉凶。常言说：“风水轮流转”，意即是指风水上的吉凶绝对的带有时间性，吉和凶是有条件的存在着，或说是相对存在着的。
三元九运表
现将最近"三元九运表"列出：
上元
一运1864年--1883年(甲子年至癸未年)
二运1884年--1903年(甲申年至癸卯年)
三运1904年--1923年(甲辰年至癸亥年)
中元
四运1924年--1943年(甲子年至癸未年)
五运1944年--1963年(甲申年至癸卯年)
六运1964年--1983年(甲辰年至癸亥年)
下元
七运1984年--2003年(甲子年至癸未年)
八运2004年--2023年(甲申年至癸卯年)
九运2024年--2043年(甲辰年至癸亥年)
从黄帝元年到现在已经经历了七十九个大运，2004～2023年，是下元的第八运。
注意：以上公历年份和干支历年份只是大概对应关系，公历和干支历的年份起点不同。
下元八运：二零零四年至二零二三年（三吉门）
第一吉门：（正神）东北位开门为[旺气门]主事业财运有大进展。
第二吉门：（生气）正南位开门为[生气门]主事业财运稳步上扬。
第三吉门：（进气）正北位开门为[进气门]主事业财运较以前稳定进步。
下元九运：二零二四年至二零四三年（三吉门）
第一吉门：（正神）正南位开门为[旺气门]主事业财运有大进展。
第二吉门：（生气）正北位开门为[生气门]主事业财运稳步上扬。
第三吉门：（进气）西南位开门为[进气门]主事业财运较以前稳定进步。
三元九运速查表
上元：
一运坎（北方): 一白星五行属水（一八六四年至一八八三年，一白星主事)当运。
二运坤（西南): 二黑星五行属土（一八八四年至一九零三年，二黑星主事)当运。
三运震（东方): 三碧星五行属木（一九零四年至一九二三年，三碧星主事)当运。
中元：
四运巽（东南): 四绿星五行属木（一九二四年至一九四三年，四绿星主事)当运。
五运 （中宫): 五黄星五行属土（一九四四年至一九六三年，五黄星主事)当运。
六运乾（西北): 六白星五行属金（一九六四年至一九八三年，六白星主事)当运。
下元：
七运兑（西方): 七赤星五行属金（一九八四年至二零零三年，七赤星主事)当运。
八运艮（东北): 八白星五行属土（二零零四年至二零二三年，八白星主事)当运。
九运离（南方): 九紫星五行属火（二零二四年至二零四三年，九紫星主事)当运。
邵子所创的元运说，是用于预测天运时运的。
“三元九运”是玄空风水的核心，大到元运，小到年月日时随着宇宙各星球的位置不同，对地球的影响也不同，因而风水也不同。比如，现在正处于下元八运期间（2004年至2023年），这段时间从风水的大环境来看是“八白艮卦”在值班，也就是“八白星”当令。
